برخی از مهاجران افغان در ایران ادعا می‌کنند که اخیراً در شماری از محلات با بدرفتاری از سوی ساکنان محل روبرو هستند و به گفتۀ آنان، این مسئله مشکلات قبلی آنان را چند برابر ساخته است. آنان مدعی‌اند که شماری از مهاجران افغان در برخی مناطق از سوی عده‌ای از ایرانی‌ها مورد لت و کوب قرار گرفته‌اند و حتی وسایل شخصی‌شان سرقت شده است.
یک مهاجر افغان در ایران که به علت حساسیت موضوع نخواست نامش در گزارش ذکر شود، روز دوشنبه در صحبت با رادیو آزادی در این مورد گفت:
"مشکلات از هر طرف زیاد است. ما در «منطقه ۱۷ شهریور» می‌نشینیم. پس از موضوعی که بین ایرانی و افغانی شده هرکسی را گیر کنند، مدارک داشته باشد نداشته باشد می‌برد، در وقت بردن لت هم می‌کند. ما ساعت ده شب با مامایم طرف خانه می‌رفتم، سه بچه ما را ایستاد کرد، هم لت‌وکوب کردند و هم موبایل‌های ما را گرفتند."
یک مهاجر دیگر افغان در ایران که او نیز نخواست نامش در گزارش گرفته شود، به رادیو آزادی گفت که بارها مورد بدرفتاری از سوی مردم محل در ایران قرار گرفته است:
"افغانی‌ها خیلی تحت شکنجه هستند. هرجای که می‌روند ده دوازده نفر بالای‌شان حمله می‌کنند لت و کوب می‌کنند. اگر نانوای برای گرفتن نان می‌روند و یا مغازه برای خرید می‌روند، شخصاً به خودم چند بار کنایه گفتند و گفتند افغانی‌های پدرسگ به وطن خود برگردید، همین قسم حرف‌های توهین‌آمیز به ما می‌زنند."
براساس گزارش‌ها، آزار و اذیت و بدرفتاری پولیس و شماری از ایرانیان در برابر مهاجران افغان پس از آن افزایش یافته که نزدیک به یک هفته پیش یک جوان افغان به قتل کارفرما ایرانی‌اش که مالک یک رستورانت بود، متهم شد. با آن‌که هویت قاتل و انگیزه قتل از سوی پولیس ایران روشن نشده اما برخی ادعا وجود دارد که عامل این قتل یک جوان ۱۷ ساله افغان بوده است.
پس از این رویداد، مردم محل در منطقه خلنج ولسوالی خوردر ولایت فارس ایران حتی با حمله به خانه‌های مهاجران افغان برای به آتش کشیدن آن تلاش کردند که سبب فرار شماری از افغان‌های ساکن از محل زندگی‌شان در این منطقه شد.
این درحالی‌ست که روز جمعه ۲۷ جولای نوارهای تصویری از منطقه ۱۵ تهران در شبکه‌های اجتماعی منتشر شده که نشان می‌دهد ساکنان این منطقه با سر دادن شعار «مرگ بر افغانی» از چگونگی مدیریت حکومت ایران در امور مربوط به مهاجران افغان اعتراض کردند. گفته می‌شود که این اعتراضات نیز در پیوند به ادعای کشته شدن یک ایرانی از سوی جوان افغان در ایران صورت گرفته بود.
همزمان با این، اخیراً موج تازه‌ای از کمپاین‌های آنلاین از طریق شبکه‌های اجتماعی در ایران به‌راه افتاده که در آن بر خواسته‌ها برای اخراج مهاجران افغان از آن کشور تأکید شده است.
از سوی هم، گزارش‌ها می‌رسانند که برخی از مهاجران افغان در ایران مدعی هستند که حکومت ایران سالانه از هر خانواده از ۱۰۰ تا ۲۰۰ میلیون ریال که معادل حدود ۲ تا ۵ هزار دلار است، برای ادامه اقامت‌شان در این کشور و دسترسی به خدمات درخواست پرداخت کرده و هشدار داده که عدم پرداخت این مقدار پول منجر به اخراج آن‌ها از ایران خواهد شد.
با این حال، روند اخراج مهاجران افغان از ایران نیز در هفته‌های اخیر شدت گرفته و روزانه صدها مهاجر از آن کشور اخراج می‌شوند. به اساس آمار وزارت مهاجرین و عودت کنندگان حکومت طالبان، تنها در روز شنبه ۶ اسد، ۱۰ هزار مهاجر از ایران به افغانستان بازگشت داده شده‌اند.
